東衛里地名濫觴於明朝永曆十五年（公元1661年）迄今四百年歷史未曾改變。

沿革－明朝永曆十五年春天鄭成功率領戰船數百艘，軍隊二萬多人自金門開到澎湖，鄭家軍於登陸「娘媽宮」後，設「澎湖安撫司」即派一名將領名叫楊祖，率領一千多名官兵到距「娘媽宮」東方約二里處海岸部署軍防，由於軍防據點是在「娘媽宮」之東，因此鄭家軍取「東衛」為名。清朝時代叫做「東衛社」，屬東西澳管轄，「東西澳」的全銜是「東衛西衛澳」，因為鄭成功登陸澎湖後派出三名將領－－楊祖、林福、張在等分別在「娘媽宮安撫司」後面三處海岸部署防守據點－－即「東衛」、「中衛」、「西衛」。

清朝的澎湖地方政「澎湖海防糧捕廲」，因而沿襲鄭家軍所取名，規劃「東西澳」這個行政區域。「東西澳衙門」的地點，相傳是設在今國立馬公高中東側海岸，（原縣農會倉庫附近）即「中衛」，鄭家軍的將領之一－林福曾率領一千多官兵在此處駐防，如日本殖民政府於清朝光緒二十年「公元1896年」，規劃澎湖基層行區域時，仍叫「東衛社」，光復初期東衛與安宅里「宅腳嶼」合為一個里，民國四十年實施地方自治才與安宅里分開，成為一個東衛里。轄內居民大部份以軍公教及從事營造與務農等，及以呂、莊等姓氏較多。 

1.東衛里天后宮為民眾信仰中心，主神媽祖（天上聖母）農曆三月廿三日誕辰，副神；姜太真君四月六日誕辰，同公宮城隍八月十五日魯班尊王、林、葉、薛三府千歲二月十九日、八月十八日、十一月廿七日誕辰，其他有客神：康、方、徐等三府千歲，八月八日、九月十六日、十一月十五日為誕辰，常推行舉辦相關文教活動。

本市十大姓氏名列第八，惟東衛里呂姓一支衍派最廣、子孫遷遍及各地，綿綿瓜瓞，蔚成巨族。

東衛呂氏：開澎祖呂成都，攜愛娘、三娘、尾娘三女於清順治年間（自公元1644－1661年間）自金門林兜徒至東衛，其後族人有四遷至西嶼小池角、內垵、外垵等，有南遷至望安山寮社，後再衍至七美嶼（原大嶼者），亦有忠遷至大赤崁、小赤崁者。

3.東衛社村前井傍邊有留一石碑、銘曰「正甘泉萬代井」

澎湖紀畈「井泉」條有：「東衛社村前井，水最清冽，且泉流甚旺，即亢亦不乾涸。距廲署三里，署中煎茶必取此水。實澎湖之第一泉也。

澎湖廲志卷一「山川」條有：「東衛社村前井。水最清冽，且泉流甚旺，旱亦不涸，距廲治三里，署中煎茶常取此水。澎之第一泉也。」 

資料來源：馬公市公所│里鄰介紹│東衛里